L'observation des déchets fait partie des missions historiques d'Alterre. Pendant plus de 10 ans, l'agence s'est occupée de la compilation, la consolidation et l'analyse des données et des tendances à l'échelle de la Bourgogne. Pour réaliser ce travail d'observation, elle s'est appuyée sur le réseau des observatoires départementaux qu'elle coordonnait.
L'agence observe maintenant l'évolution des déchets ménagers et assimilés sur la grande région. Elle alimente le plan régional de prévention et de gestion avec les données et informations qu'elle collecte et qu'elle traite. Elle apporte son expertise dans le cadre de l'élaboration et du suivi de la politique régionale.
Enfin, l'agence produit des documents d'information et de sensibilisation à destination des décideurs, des gestionnaires, des collectivités, des associations. Pour connaître l'état des lieux et suivre l'évolution de la gestion et de la prévention des déchets au fil du temps, consulter la synthèse annuelle.